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EUROSCARF 收集中心已建立，用于存放和交付基因組分析網絡中生成的生物材料。其中包括以下項目：BMBF（325 個 ORF）、EUROFAN I（800 個 ORF）和作為*酵母基因缺失項目（6000 個 ORF）一部分的 EUROFAN II。當可用時，含有缺失盒或互補基因的質粒也有庫存。缺失菌株的遺傳背景因項目而異。在許多情況下，您可以選擇不同的遺傳背景。 德國酵母功能分析項目 在 BMBF（Bundesministerium für Bildung und Forschung）支持的德國酵母功能分析項目（1994-1997）期間，325 個基因已被刪除。 15 個實驗室的合作致力于基因的缺失和缺失菌株的功能分析（Entian 等：Mol Gen Genet 262 (1999) 683-702）。所有缺失均在菌株 CEN.PK2 中完成。由于該項目的早期啟動，大多數基因缺失是通過用營養(yǎng)缺陷型標記替換感興趣的基因來實現的。大約三分之一的缺失是通過 PCR 技術進行的。出于這個原因，有多種轉化標記可以用來替換基因。從這個項目 EUROSCARF 擁有交配類型和雜合二倍體菌株的單倍體菌株。只有雜合二倍體可用于必需基因。該項目貢獻的菌株可以通過登錄號中的前 B 后跟 4 位數字代碼和終端字母來識別。 EUROFAN I |
115 個團體的合作得到了歐盟的支持。該項目始于 1/96，800 個開放閱讀框被刪除和分析。每個參與實驗室都負責刪
除和初步分析六個基因 (sixpack)。 Wach 等人已經制定了刪除策略。 (酵母 10 (1994) 1793-1808)。該策略基于 PCR 片段刪除相應的開放閱讀框。缺失存在于三種不同的遺傳背景中。必須刪除 FY1679 背景中的所有開放閱讀框，與 S288C 同基因，S288C 是釀酒酵母基因組測序的來源。除了大多數基因的缺失之外，在 CEN.PK2 或 W303 中還產生了一組額外的缺失，以證明缺失盒是普遍使用的。在第一階段構建的菌株通過登錄號中的 5 位數字代碼后跟對應于菌株交配類型的終端字母來標識。 根據EUROFAN I的指導方針，還收集了所有缺失質粒。除此之外，對于大多數基因，還有用于互補缺失基因的質粒。 *基因缺失項目（EUROFAN II） 在*范圍內，歐洲和海外實驗室聯合在 Saccharomyces 基因組缺失項目聯盟中（Winzeler 等人：Science 285 (1999) 901-906）。歐洲任務被標記為 EUROFAN II。所有構建的菌株將由 EUROSCARF 收集。缺失是在與 S288c（其 DNA 序列已確定的釀酒酵母菌株）同基因的遺傳背景中進行的。 II期構建的缺失菌株均在BY菌株系列的遺傳背景中。 這些菌株的 EUROSCARF 登錄號與 Saccharomyces 基因組刪除項目給出的記錄號僅通過前面的字母 Y 不同。 |
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